El Parlamento del MERCOSUR tiene como competencia el análisis de dos presupuestos: el de la Secretaría del MERCOSUR y el suyo propio.
Conforme el art. 4, 20, del Protocolo Constitutivo, el Parlamento debe elaborar y aprobar su presupuesto e informar sobre su ejecución al Consejo del Mercado Común dentro del primer semestre del año posterior al ejercicio.
Asimismo, durante el primer semestre de cada año el Parlamento debe recibir un Informe sobre la ejecución del presupuesto de la Secretaría del MERCOSUR del año anterior.
La Comisión responsable de este análisis es la Comisión de Presupuesto y Asuntos Internos del Parlamento del MERCOSUR.